代謝組學什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學研究。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細胞和微生物、培養液和發酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發生變化,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態,因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請參照譜領生物樣本收集步驟文件。代謝組學作為系統生物學的重要組成部分,在臨床醫學領域具有普遍的應用前景。貴州植物靶向代謝組學檢測多少錢
代謝組學有哪些研究方式?根據有沒有研究目標或方向來確定,在不確定代謝物或者代謝途徑時可使用非靶向代謝組學尋找切入點,在有目標時則使用靶向定量進行深入研究,針對性研究脂質的則可以使用脂質組學技術。另外比較新的,譜領生物還提供基于穩定性同位素示蹤技術的代謝流組學技術服務來研究代謝流量問題。什么是代謝組學?代謝組學是末期發展起來的一門新興學科,是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內源性代謝物質的代謝途徑及其所受內在或者外在因素的影響及隨時間變化的規律。代謝組學通過揭示內在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發展過程。江蘇靶向代謝組學定性分析代謝組學是繼基因組學、蛋白質組學、轉錄組學后出現的新興“組學”。
什么是非靶向代謝組學、靶向代謝組學?(1) 非靶向代謝組學(Untargeted metabolomics)即非目標代謝組學或發現代謝組學,無偏向性地對所有小分子代謝物(一般相對分子量小于1000)同時進行檢測分析的代謝組學。(2) 靶向代謝組學(Trgeted metabolomics)則為目標性代謝組學,著重對于設定好的目標代謝物進行定性、量檢測分析和研究。相比于其他組學,代謝組學有哪些特殊的優勢?系統生物學有基因組學、轉錄組學、蛋白組學和代謝組學。代謝組學作為系統生物學的一個重要的分支,與其他組學相比有著其特有的優勢,主要體現在以下幾點:(1) 基因與蛋白質表達的微小變化會在相應代謝物水平上得到放大,更容易被檢測。(2) 代謝物的種類要遠小于基因和蛋白的數目。(3) 可與生物表型變化建立直接相關性。
代謝組學樣本收集注意事項:1.對于動物組織樣本無法滿足50mg/樣,如海馬組織,大腦組織等,可考慮同組混樣以達到50mg/樣的要求。2.對于含水量高的果實進行取樣很難保持高度均一性(如番茄的果皮、果肉等),建議將整個果實進行液氮研磨后凍干混勻,對混勻后的粉末進行稱重分裝,凍存。3.盡量不要使用錫箔紙以及自封袋包裝樣本,建議將樣本液氮研磨后使用離心管/凍存管進行分裝。4.在使用PBS緩沖液/超純水進行漂洗時,需要盡快處理。5.植物各類組織樣本建議都使用超純水進行漂洗完之后,再研磨分裝凍存,防止因種植過程中施加的一些肥料、農藥等含有表面活性劑或其他雜質,對后續實驗造成影響。代謝組學主要研究的是各種代謝路徑的底物。
代謝組學概念:基因與蛋白質的表達緊密相連,而代謝物則更多地反映了細胞所處的環境,這又與細胞的營養狀態,藥物和環境污染物的作用,以及其它外界因素的影響密切相關。因此有人認為,“基因組學和蛋白質組學告訴你什么可能會發生,而代謝組學則告訴你什么確實發生了。”代謝組學的概念來源于代謝組,代謝組是指某一生物或細胞在一特定生理時期內所有的低分子量代謝產物,代謝組學則是對某一生物或細胞在一特定生理時期內所有低分子量代謝產物同時進行定性和定量分析的一門新學科。它是以組群指標分析為基礎,以高通量檢測和數據處理為手段,以信息建模與系統整合為目標的系統生物學的一個分支。代謝組學的研究對象與層次有哪些?山東動物靶向代謝組學檢測多少錢
代謝組學與臨床化學較為相似。貴州植物靶向代謝組學檢測多少錢
代謝組學的研究分為靶向和非靶向。通俗說就是你有沒有目標分子。傳統代謝組學研究利用的是GC-MS,因為代謝物大多數都不是高沸點的,而且GC-MS有龐大的數據庫檢索。然后發展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸點物質難以檢測的弊端。NMR用于代謝組學不是很多,一方面是NMR這個東西入行起點有點高,另一方面是樣品太復雜而且靈敏度不高。但是NMR樣品處理簡單,無損。不需要各種衍生化。而且NMR對于物質結構的指認要比MS更精確(比如異構體)因此對定性非常有用,成為非靶向代謝組學的重要方法。貴州植物靶向代謝組學檢測多少錢
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