蛋白質磷酸化修飾組學技術:蛋白質的磷酸化修飾是生物體內重要的共價修飾方式之一。磷酸化修飾本身所具有的簡單、靈活、可逆的特性,以及磷酸基團的供體ATP的易得性,使得磷酸化修飾被真核細胞所選擇接受成為一種普遍的調控手段。蛋白質的磷酸化和去磷酸化這一可逆過程,幾乎調節著包括細胞的增殖、發育、分化、細胞骨架調控、細胞凋亡、神經活動、肌肉收縮、新陳代謝發生等生命活動的過程,并且可逆的蛋白質磷酸化是目前所知道的主要的信號轉導方式。目前已經知道有許多人類疾病是由于異常的磷酸化修飾所引起,而有些磷酸化修飾卻是某種疾病所導致的后果。蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有可逆的特性。武漢蛋白質丙二酰化修飾組學鑒定
蛋白質有哪些翻譯后修飾?作用機制和生物學功能是什么?前體蛋白是沒有活性的,常常要進行一個系列的翻譯后加工,才能成為具有功能的成熟蛋白。加工的類型是多種多樣的,一般分為以下幾種:N-端fMet或Met的切除、二硫鍵的形成、化學修飾和剪切。當合成蛋白質時,20種不同的氨基酸會組合成為蛋白質。蛋白質的翻譯后蛋白質其他的生物化學官能團(如醋酸鹽、磷酸鹽、不同的脂類及碳水化合物)會附在蛋白質上從而改變蛋白質的化學性質,或是造成結構的改變(如建立雙硫鍵),來擴闊蛋白質的功能。再者,酶可以從蛋白質的N末端移除氨基酸,或從中間將肽鏈剪開。舉例來說,胰島素它會在建立雙硫鍵后被剪開兩次,并在鏈的中間移走多肽前體,而形成的蛋白質包含了兩條以雙硫鍵連接的多肽鏈。蛋白質琥珀酰化修飾組學一般流程乙酰化修飾對細胞核內轉錄調控因子的刺激有著非常重要的作用。
蛋白質翻譯后修飾組學:蛋白質翻譯后修飾(Post-translational modification, PTM)是指對翻譯后的蛋白質進行共價加工的過程。它通過在一個或多個氨基酸殘基加上修飾基團,可以改變蛋白質的物理、化學性質,進而影響蛋白質的空間構象和活性狀態、亞細胞定位、折疊及其穩定性以及蛋白質-蛋白質相互作用。蛋白質翻譯后修飾的豐度變化在生命活動研究中具有重大意義,異常的翻譯后修飾會導致多種疾病的發生。質譜可以分辨蛋白質修飾前和修飾后分子量上的變化,因此只要知道靶蛋白翻譯后修飾前后分子量的變化,就能對翻譯后修飾方式進行鑒定和定量。
蛋白質磷酸化修飾組學技術優點:1、全方面性:磷酸化蛋白質組學以整個細胞蛋白為研究對象,研究內容包括了細胞內具有生命功能的蛋白,如細胞增生、細胞分裂和細胞分化等相關蛋白,因而研究更為全方面。2、可靠性:傳統的生物學研究蛋白質磷酸化往往針對特定條件,以兩個蛋白或更多蛋白之間的相互作用為出發點,具有局限性,缺乏整體認識。磷酸化蛋白質組學則可檢測不同蛋白激酶及磷酸化酶對同一個蛋白磷酸化程度的影響,因而結果具有普遍性和可靠性。3、有效性:磷酸化蛋白質組學反映的是細胞內真實發生的事件,在一次試驗中考慮了不同變量,克服了生物學中逐步添加變量的缺陷。4、探索性:磷酸化蛋白質組學以細胞內蛋白為研究對象,相對于傳統的生物學研究以及蛋白質芯片,更易發現未知的新磷酸化位點和磷酸化蛋白質。如果可以聯合生物學技術,則可以發現具有磷酸化或者去磷酸化功能的酶。泛素化修飾還可以直接影響蛋白質的活性和定位。
翻譯后修飾蛋白組學分析:蛋白質組學的研究的工作不只聚焦于細胞不同生長時期或是疾病條件下的蛋白質表達水平變化,許多至關重要的生命進程不只由蛋白質相對豐度控制,更重要的是被時空特異分布的、可逆的翻譯后修飾所調控,因而揭示翻譯后修飾發生規律是解析蛋白質復雜多樣的生物功能的一個重要前提。蛋白質發生翻譯后修飾時其分子質量會發生響應的改變,通過質譜能夠精確測定蛋白質或多肽的分子質量。同時,發生翻譯后修飾的蛋白質再樣本中含量低且動態范圍廣,所以在質譜檢測前需要對發生修飾的蛋白質或肽段進行富集。質譜是蛋白質翻譯后修飾檢測的常用技術之一。杭州乙酰化修飾蛋白質組學鑒定
乙酰化修飾是體內保守的可逆轉的蛋白修飾。武漢蛋白質丙二酰化修飾組學鑒定
翻譯后修飾蛋白組:翻譯后修飾蛋白組分析是指在組學水平上對存在翻譯后修飾的蛋白質進行分析。翻譯后修飾蛋白組是指細胞或組織等整體水平上的翻譯后修飾蛋白。蛋白質的翻譯后修飾(Post Translational Modifications, PTMs)是蛋白質在翻譯中或翻譯后經歷的一個共價加工過程。蛋白翻譯后修飾通過在一個或多個氨基酸殘基上加修飾基團或通過蛋白質水解去基團而改變蛋白質的性質,調節蛋白質的功能。經過翻譯后修飾的蛋白質稱為翻譯后修飾蛋白。目前,已知的蛋白質翻譯后修飾主要包括糖基化、磷酸化、乙酰化、泛素化、二硫鍵配對、甲基化和亞硝基化等等。武漢蛋白質丙二酰化修飾組學鑒定
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