代謝組學是研究關于生物體被擾動后(如基因的改變或環境變化后)其代謝產物(內源性代謝物質)種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生物整體、組織的內源性代謝物質的代謝途徑及其所受內在或者外在因素的影響及隨時間變化的規律。代謝組學通過揭示內在和外在因素影響下代謝整體的變化軌跡來反映某種病理生理過程中所發生的一系列生物事件。代謝組學在系統生物學的末端。以人體為例,對基因序列信息研究是基因組學的范疇。轉錄組學研究基因在外在或內在環境刺激下不同的表達。基因信息翻譯成蛋白質后,各種蛋白的形狀、功能、相互關系是蛋白組學的研究范疇。各種營養物質經過人體的消化、代謝后的代謝物,就是代謝組學的研究范圍。代謝組學主要技術手段是色譜(HPLC,GC)。北京植物靶向代謝組學分析研究
代謝組學應用方向:腸道菌群代謝組學,運用代謝組學檢測腸菌代謝物的動態變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態,直觀的研究腸道菌群與疾病發生的發展的關系,為疾病的預防,調高宿主的健康水平提供新的思路。經典脂質組學:對生物體、組織或細胞中的脂質以及與其相互作用的分子進行全方面系統的鑒定分析。了解脂質的結構和功能,揭示脂質代謝與細胞乃至機體的生理、病理過程之間的關系,普遍運用于分子生理學、功能基因組學以及環境與健康等重要領域。上海動物靶向代謝組學主要技術代謝組學是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規律。
代謝組學介紹:通過液質聯用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內大多數小分子代謝物的動態變化,重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物,進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系,其研究對象大多是分子量1500Da以內的小分子物質。技術優勢:較高的靈敏度、分辨率;較寬的動態范圍;適合對標本中未知代謝物的探索研究;適合于生物樣本中復雜代謝產物的檢測和潛在標志物的鑒定。代謝組學應用方向: 土壤代謝組學。研究土壤中有機質及土壤微生物代謝含量變化及相互作用,了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力,為探索調節、控制和改善土壤環境質量提供重要的參考。
藥物代謝和代謝組學區別:代謝組學與藥物代謝不同是它關注的對象不是外源性的藥物而是生物體本身就有的內源性代謝物。這些代謝物是糖,脂肪,蛋白質,核酸,膽汁酸等等代謝得到的。還有共生菌代謝的,是一個龐大的混合物。目的是通過樣本的對比,發現潛在標志物,指導疾病早期診斷甚至基因水平的研究。而藥物代謝的目標是只要只要追蹤到這種藥物分子在體內變化就好,相當具有靶向性,因此使用的技術手段就是LC-MS。檢測藥物的中間體,和具體的藥效,藥代動的效應。代謝組學的研究處于生物信息流的中游。
代謝組學樣本收集指南:1.血漿樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到標記的肝素鋰血漿收集管中(肝素鋰用作抗凝劑)。(2)立即于4 °C離心(3000g)20min,上清液即為血漿。(3)離心完畢,取出血漿收集管,取上清液(血漿),分等份(0.5mL或0.1mL),轉移到凍存管中(冰上),旋蓋。(4)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。2.血清樣本收集:(1)從合適的靜脈采集血液(典型10mL)到血清收集管中。(2)將血清收集管冰水浴(4℃)凝集至少1h(2h以內),記錄凝集時間。(3)將血清收集管放到冷凍離心機中低溫(4℃)離心15min(2500 g)。(4)離心完畢,取出血清收集管,取上清液,分等份(0.5mL或0.1mL),轉移到凍存管中(冰上),旋蓋。(5)保存于-80℃冰箱。寄樣需足量干冰。代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發展起來的一門學科。河南靶向代謝組學定性分析
在食品安全領域,利用代謝組學工具發現農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。北京植物靶向代謝組學分析研究
代謝組學研究方法:代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似,通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色譜-質譜聯用(LC-MS)的方法,比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說,代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜峰,然后了解不同化合物的結構,建立一套完備的識別這些不同化合物特征的分析方法。另一種方法是代謝輪廓分析(metabolomic profiling),研究人員假定了一條特定的代謝途徑,并對此進行更深入的研究。北京植物靶向代謝組學分析研究
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