蛋白質組學技術：生物質譜：生物質譜技術是蛋白質組學研究中比較重要的鑒定技術，其基本原理是樣品分子離子化后，根據(jù)不同離子之間的荷質比（M/E）的差異來分離并確定分子量。對于經(jīng)過雙向電泳分離的目標蛋白質用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的-C端形成的肽鍵）成肽段，對這些肽段用質譜進行鑒定與分析。目前常用的質譜包括兩種：基質輔助激光解吸電離-飛行時間質譜（MALDI-TOF-MS）和電噴霧質譜（ESI-MS）。蛋白質組的研究不但能為生命活動規(guī)律提供物質基礎，也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據(jù)和解決途徑。蛋白質組學包括蛋白與蛋白相互作用等。山東新型修飾蛋白組學質譜鑒定

定量蛋白質組學分析（QuantitativeProteomics）是對一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜混合體系內(nèi)所有蛋白質進行精確鑒定和定量。可用于篩選和尋找任何因素引起的樣本之間的差異表達蛋白，結合生物信息學揭示細胞生理病理等功能，同時也可對某些關鍵蛋白進行定性和定量分析。目前定量蛋白質組學技術常見標記（Label）和非標記的（LabelFree）定量策略。定量蛋白質組學技術常見的幾類主要包括：LabelFree定量蛋白組分析、SILAC與免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白組學分析、SILAC/Dimethyl標記定量蛋白組分析、SWATH定量蛋白組學、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白組學分析。浙江定量乙酰化蛋白質組學技術在對早老性癡呆等人類重大疾病的臨床診斷和治理方面蛋白質組技術也有十分誘人的前景。

非標定量法(Label-free)是通過比較質譜分析次數(shù)或質譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數(shù)量變化，認為肽段在質譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關，因此蛋白質被質譜檢測的計數(shù)反映了蛋白質的豐度，通過適當?shù)臄?shù)學公式可以將質譜檢測計數(shù)與蛋白質的量聯(lián)系起來,從而對蛋白質進行定量。按照其原理主要分為兩種，第1種spectrumcounts類的非標記方法，發(fā)展比較早，已經(jīng)形成多種定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鑒定結果為定量基礎，各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。第二種非標記定量的原理是以MS1為基礎，計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分。

蛋白組學研究怎么做？PRM:平行反應監(jiān)測(ParallelReactionMonitoring)是一種基于高分辨、高精度質譜的離子監(jiān)視技術，能夠對目標蛋白質、目標肽段（如發(fā)生翻譯后修飾的肽段）進行選擇性檢測，從而實現(xiàn)對目標蛋白質/肽段進行一定定量，因此也被稱之為基于液相色譜質譜聯(lián)用技術的WesternBlot（LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB）。PRM技術基于Q-Orbitrap為表示的高分辨、高精度質譜平臺，首先利用四級桿質量分析器的選擇能力，用Q1選擇目標肽段的母離子，隨后在Collisioncell中對母離子進行碎裂，之后利用Orbitrap分析器在二級質譜中檢測所選擇的母離子窗口內(nèi)的所有碎片信息。這樣即可對復雜樣本中的目標蛋白質/肽段進行準確地特異性分析。蛋白質組學技術并帶領生物技術取得關鍵性的突破。

蛋白質組學：常用技術：靶向蛋白組（PRM靶向蛋白/肽段定量），修飾蛋白組學（定量磷酸化修飾組學、定量糖基化修飾蛋白組學、定量乙酰化修飾蛋白組學和定量泛素化修飾蛋白組學），互作蛋白組學（代謝物與蛋白互作研究）。什么樣本能做蛋白組學檢測？大概可以測到多少的蛋白種類？原則上只要能提取到蛋白，就可以做蛋白組檢測。樣本測到的蛋白種類跟數(shù)據(jù)庫和樣本本身蛋白濃度有關，一般數(shù)據(jù)庫越大，可以鑒定到的蛋白質數(shù)量越多。也與樣本的類型有關，通常，組織細胞相比于體液樣本，能夠鑒定到更多的蛋白。蛋白質組學相關技術目前在一小部分]應用中具有獨特優(yōu)勢。山東新型修飾蛋白組學質譜鑒定

蛋白質組學研究不僅是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業(yè)帶來巨大的利益。山東新型修飾蛋白組學質譜鑒定

定量蛋白質組學技術：定量蛋白質組學是蛋白質組研究的重要內(nèi)容，通過對基因表達產(chǎn)物——蛋白質的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境條件下的表達情況。近年來，隨著非凝膠技術的發(fā)展，蛋白質組學（“Shotgun”proteomics）技術，特別是多維蛋白質鑒定（MultidimensionalProteinIdentification，MudPIT）已成為研究復雜生物樣本中大規(guī)模蛋白質表達和定性和定量分析的強有力工具。蛋白質組學在醫(yī)學的研究應用：蛋白質組學是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學。山東新型修飾蛋白組學質譜鑒定

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