代謝組學比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法：多變量分析：多變量分析方法能同時處理數(shù)百或數(shù)千個變量，并且能處理變量之間的相互關系。利用變量之間的協(xié)方差或相關性，使原始數(shù)據(jù)在較低維空間上的投影能盡可能地捕獲數(shù)據(jù)中的信息。但是如果存在大量無信息變量可能會妨礙多變量分析的能力，無信息變量的數(shù)量越多，減少真陽性數(shù)量的效果就越明顯。多變量分析分為無監(jiān)督分析方法和有監(jiān)督分析方法。在代謝組學分析中無監(jiān)督學習有主成分分析只需要數(shù)據(jù)集X，而有監(jiān)督分析方法主要是偏比較小二乘判別分析和正交偏比較小二乘判別分析，這類方法在分析時除了需要數(shù)據(jù)集X，還需對樣品進行指定并分組, 這樣分組后模型將自動加上另外一個隱含的數(shù)據(jù)集Y，通常Y的賦值用-1/1或者0/1表示類別信息。代謝組學研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。貴陽脂質(zhì)代謝組學多定性分析

代謝組學在系統(tǒng)生物學中有什么作用？它的地位如何？代謝物作為生物體表型的基礎能夠幫助我們更直觀有效地了解生命現(xiàn)象揭示生命本質(zhì)。代謝組學本質(zhì)上是指從整體上研究生物體的代謝物，是對某一生物、組織或細胞中的所有低分子量代謝產(chǎn)物進行定性與定量分析的一門科學。代謝組學以指標分析為基礎，高通量檢測為手段，通過研究生物體內(nèi)代謝物的種類與數(shù)量及其變化規(guī)律來闡述機體在正常生命狀態(tài)及環(huán)境變化后的代謝過程。代謝組是系統(tǒng)生物學的分支學科之一。其研究內(nèi)容主要包括對代謝物進行定性或定量分析，不同基因型的生物體進行代謝組學表型研究，不同生長環(huán)境及加物理、化學或生物性刺激后個體代謝產(chǎn)物的應答，進行代謝途徑或代謝網(wǎng)絡解析與轉基因評價。廣東農(nóng)學靶向代謝組學質(zhì)譜分析代謝組學是繼基因組學、蛋白質(zhì)組學、轉錄組學后出現(xiàn)的新興“組學”。

代謝組學比較常用到的數(shù)據(jù)分析方法：代謝組學分析數(shù)據(jù)用于統(tǒng)計分析時，數(shù)據(jù)集通常為一個N × K的矩陣（X矩陣），N表示N個樣本數(shù)，每一行表示一個樣品， K表示K個變量，每一列表示一個變量，在代謝組學中變量通常是指代謝物含量。單變量分析方法只分別分析單個變量，不考慮多個變量的相互作用與內(nèi)在聯(lián)系。具有簡單性、易應用性和可解釋性。但是無法基于整體數(shù)據(jù)對所測樣品的優(yōu)劣、差異進行綜合評價和分析。差異倍數(shù)變化大小（Fold Change，F(xiàn)C）表示實驗組與對照組的含量比值，可以快速考察各個代謝物在不同組別之間的含量變化大小。

代謝組學：代謝組學 （metabolomics）的出現(xiàn)是生命科學研究的必然。是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產(chǎn)物進行定性和定量分析的一門新學科。代謝組作為系統(tǒng)生物學的重要組成部分，在臨床醫(yī)學領域具有普遍的應用前景。 代謝產(chǎn)物是基因表達的產(chǎn)物，在代謝酶的作用下生成。雖然與基因或蛋白質(zhì)相比，代謝產(chǎn)物較小，但是不能形成代謝產(chǎn)物的細胞是死細胞，因此不能小看代謝產(chǎn)物的重要性。 研究人員通過對機體代謝產(chǎn)物的深入研究，可以判斷機體是否處于正常狀態(tài)，而對基因和蛋白質(zhì)的研究都無法得出這樣的結論。事實上，代謝組學研究已經(jīng)能診斷出一些代謝類疾病，如糖尿病、肥胖癥，代謝綜合癥。目前，已經(jīng)研究清楚的普通代謝途徑包括三羧酸循環(huán)（TCA），糖酵解，花生四烯酸 （AA）/炎癥途徑。非靶向代謝組學（Untargeted metabolomics）即非目標代謝組學或發(fā)現(xiàn)代謝組學。

代謝組學發(fā)展前景：代謝組學是繼基因組學、蛋白質(zhì)組學、轉錄組學后出現(xiàn)的新興“組學”,每年發(fā)表的代謝組學研究的文章數(shù)量都在不斷增加。代謝組學的發(fā)展很迅速，盡管還沒有經(jīng)典論文出現(xiàn),但是研究人員相信，與基因組學和蛋白質(zhì)組學相比，代謝組學將在臨床上發(fā)揮更大的作用。許多公司通過市場研究發(fā)現(xiàn)，健康人并不希望進行基因型分析，所以，對于這些人群來說，基因組學研究在臨床上的應用很有限。而代謝組學與臨床化學較為相似，且相對于基因組學來說，提供的個人信息更少，故其在臨床上的應用有可能產(chǎn)生一定的影響。代謝組學技術可應用于病因病機研究。貴陽脂質(zhì)代謝組學多定性分析

代謝組學技術可應用于功能基因組學。貴陽脂質(zhì)代謝組學多定性分析

代謝組學尿液樣本收集：1）取空腹晨尿、中段尿（臨床）或晨間1 h尿（動物）于50 mL離心管中；2）4 ℃ 下10000 rpm離心10 min取上清，用1.5 mL離心管分裝，保存于-80 ℃。3）動物1 h尿量不夠的情況下，可分多次收集尿液；如需收取24 h尿液，需要使用帶低溫裝置的代謝籠收集，并且及時凍存樣本。4）收集完尿液樣本后，建議使用液氮淬滅15 min后，再分裝多管后于-80 ℃凍存。組織樣本收集：動物組織（包括腦、心、肝、脾、肺、腎、肌肉和皮膚等；軟體動物如血吸蟲）：1）取適量組織，用預冷的PBS緩沖液或生理鹽水清洗干凈；2）迅速剝?nèi)シ潜匦璧闹竞徒Y締組織，再用PBS緩沖液或生理鹽水沖洗干凈；3）用干凈的無塵吸水紙吸干水分，將組織分成50-100 mg / 管分裝待用；4）管子上做好標記后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min，-80 ℃凍存；干冰運輸。貴陽脂質(zhì)代謝組學多定性分析

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