蛋白組學樣本寄送前是否需要精確計數或是稱量？不同樣本寄送會有不同的送樣要求，按照收集方法提供可以保證實驗用量充足。不需要精確計數或是稱量，項目開展前會進行蛋白濃度的測定，后續也是不同樣本等蛋白量處理、上機檢測，但是要保證每個樣本的寄樣量達到實驗要求。常規定量蛋白組實驗的主要步驟有哪些，數據分析內容包含哪些？實驗步驟：首先獲得生物學樣本，然后進行蛋白提取，定量，SDS-PAGE跑膠質控，還原烷基化，酶解，獲得肽段，（標記+分組分），上機檢測，搜庫軟件搜庫，數據分析；數據分析：主要分為基礎數據分析、?級數據分析和個性化數據分析三個部分。基礎分析主要包括差異表達蛋白篩選、層次聚類分析分析、COG注釋分析、亞細胞定位分析、GO注釋富集分析、KEGG注釋分析、PPI分析等。蛋白質組學研究的首要任務是建立獲取和分析蛋白質的常規、可靠、有效的技術。浙江Label free多肽組學分析方法

LabelFree(非標記蛋白質組學技術)：應用：1.需要快速在大量樣本中找到差異表達的蛋白組合。2.需要在較短時間以較低成本得到具有提示意義的蛋白表達數據。3.需要檢測的樣品蛋白含量低。4.需要檢測相互作用蛋白。技術特點：1.對質譜儀器設備要求較高，色譜和質譜需要同時有較好的穩定性和重復性。2.需要有特殊的定量分析軟件。3.對樣品中蛋白質總量要求較低，實驗周期短，實驗費用低。4.不需要額外并且昂貴的標記試劑，排除了標記過程帶入實驗誤差的風險，同時也不必考慮標記效率的問題。北京定量乙酰化蛋白質組學領域蛋白質組學本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征。

蛋白組究竟研究的是什么呢？第1，蛋白質定性，或者說大規模檢測某些蛋白質是否存在于樣品當中；第2，蛋白質定量，也就是大規模檢測某些蛋白質的含量（包括一定含量與相對含量）；第3，蛋白質翻譯后修飾，這些修飾主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙酰化等等，也包括對這些翻譯后修飾的定量研究。這三大塊中所提到的大規模，既可以是樣品數量的大規模高通量，也可以是少量樣本中蛋白數量的大規模高通量。研究原因：首先，由于翻譯調控和翻譯后調控的存在，RNA的表達量與實際對應蛋白質的含量相關性并不高，就簡單地測試了酵母中mRNA和對應蛋白質的定量相關性，結果是，低豐度蛋白與mRNA的相關性尤其低，而高豐度蛋白和其mRNA的相關性則高，經過平均后r值只為0.4。

蛋白質組學研究這樣做：蛋白質組與基因組相對應，也是一個整體的概念，隨著基因組學研究的不斷深入，蛋白質組學已逐漸成為研究熱點，對蛋白組學的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質，但探究成千上萬的蛋白質特性也是一個重大的技術挑戰。蛋白質組（Proteome）指的是某一時刻或某一狀態基因組表達的所有相應的蛋白，即細胞、組織或機體全部蛋白質的存在及活動形式，其是一個動態概念，它是在組織、細胞的整體蛋白質水平上，探索蛋白質作用模式、功能機理、調節控制以及蛋白質群體內的相互關系、從而獲得生命活動調控網絡的全方面而深入的認識，以揭示生命活動的基本規律。蛋白質組學是以蛋白質組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規律的科學。

定量蛋白質組學方法學介紹：Label-free：Label-free定量，即非標記的定量蛋白質組學，不需要對比較樣本做特定標記處理，只需要比較特定肽段/蛋白在不同樣品間的色譜質譜響應信號便可得到樣品間蛋白表達量的變化，通常用于分析大規模蛋白鑒定和定量時所產生的質譜數據。Label-free定量不需要標記處理，操作簡單，可以做任意樣本的總蛋白質差異定量，但對實驗操作的穩定性、重復性要求較高，準確性也較標記定量差。因此，Label-free技術適合于大樣本量的定量比較，以及對無法用標記定量實現的實驗設計。iTRAQ定量是目前定量蛋白質組學應用比較普遍的技術。南京新型修飾蛋白組學研究內容

定量蛋白質組學是蛋白質組研究的重要內容。浙江Label free多肽組學分析方法

蛋白質組學技術：等電聚焦：等電聚焦（isoelectricfocusing，IEF）是一種利用有pH梯度的介質分離等電點不同的蛋白質的電泳技術。等電聚焦凝膠電泳依據蛋白質分子的靜電荷或等電點進行分離，等電聚焦中，蛋白質分子在含有載體兩性電解質形成的一個連續而穩定的線性pH梯度中電泳。載體兩性電解質是脂肪族多氨基多羧酸，在電場中形成正極為酸性，負極為堿性的連續的pH梯度。蛋白質分子在偏離其等電點的pH條件下帶有電荷，因此可以在電場中移動；當蛋白質遷移至其等電點位置時，其靜電荷數為零，在電場中不再移動，據此將蛋白質分離。浙江Label free多肽組學分析方法

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