代謝組學發展至今,代謝組學技術已經遠遠超出了標準臨床化學技術的范圍,能夠精確分析數百至數千種代謝物。代謝組學提供了代謝表型的詳細表征,并可以在許多水平上進行精密醫學研究,包括表征疾病基礎的代謝紊亂,發現新的治靶標以及發現可用于診斷疾病或監測藥物的活性。比較常見的代謝組學分析方法是質譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質譜技術又分為LC-MS和GC-MS。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發生電離,生成不同荷質比的帶電荷的離子,經加速電場的作用,形成離子束,進入質量分析器。與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。湖北常規靶向代謝組學領域
代謝組學樣本收集植物組織:果實、種子:1)對于含水量高、體積較大的果實(番茄、西瓜、蘋果等)需要先將樣品分成“均勻”的小塊(≈ 200 mg/樣本)分裝至2 mL離心管中,標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。2)對于細小的顆粒種子(擬南芥種子、谷物種子等),可以先將同一組的植株種子混勻后再分裝(≈ 200 mg/樣本)至離心管中,標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15 min。3)對于要求對整個果實進行提取的(整粒葡萄等),需要把果實裝在50 mL離心管/自封袋中,標號后迅速放入液氮中冷凍處理至少15min,-80 ℃凍存,干冰寄送。湖北常規靶向代謝組學領域代謝組學的研究對象與層次有哪些?
代謝組學有哪些特點?(1) 代謝處于系統生物學的末端,更能反映基因與外部環境互作的真實情況,因此,在多數生物表型研究上更加適用。(2) 常規代謝組學只關注內源性化合物,也有使用代謝組學技術測定外源性化合物的。內源性化合物的上調和下調指示了與疾病、毒性、基因修飾或環境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 內源性化合物的結果可以作為疾病的診斷、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標志物。謝組學通過揭示內在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發展過程。
代謝組學什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學研究。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細胞和微生物、培養液和發酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發生變化,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態,因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請參照譜領生物樣本收集步驟文件。代謝組學主要研究的是各種代謝路徑的底物。
代謝組學的研究領域有哪些?1、疾病機制研究。2、疾病診斷與防治。3、新藥篩選和開發。4、藥物作用機制的研究。5、藥物毒性評價。6、植物的細胞代謝組學研究。7、微生物代謝組學研究。代謝組能夠檢測到的代謝物含量是多少?不同檢測平臺的靈敏度不一樣,靈敏度比較高,可達到fM級。另外,相同含量的不同物質,由于自身化學性質不同,質譜的離子化效率、信號響應強度會差異很大。物質的檢測靈敏度跟自身的化學性質有關,化學性質的影響主要表現在離子化效率和質譜碎裂行為兩方面。因此,相同含量的不同物質,可能一個能檢測出來,另一個檢測不出來。代謝組學研究對象大都是相對分子質量1000以內的小分子物質。浙江個性化定制靶向代謝組學方法
相比于其他組學,代謝組學有哪些特殊的優勢?湖北常規靶向代謝組學領域
靶向代謝組學的一般分析流程為:1. 數據采集 第1步是得到標準品。如果無法從市場上買到,就必須定制合成。然后通過優化產物離子碰撞能量以得到的信號,再通過測定三重串聯四極桿測定代謝物的 MRM 躍遷值。2. 定量 接下來用定量分析軟件對 MRM 數據進行處理,得到報告。3. 統計分析和解釋 將定量報告輸入統計分析軟件包,用統計工具,如ANOVA,對數據進行處理。靶向分析:在基于質譜的代謝組學分析中,要意識到離子強度和色譜保留時間都會隨著時間的推移而產生漂移,所以在實驗中,要按隨機順序對樣本進行檢測,且數據需要在同天同一批次進行采集,以減少誤差。湖北常規靶向代謝組學領域
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