蛋白質修飾位點分析:基于LC-MS/MS分析能夠精確測定蛋白質或多肽分子質量這一特性,從而檢測蛋白質或者多肽上位點發生何種修飾。可檢測修飾類型如下: 磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀酰化、單甲基化、二甲基化、三甲基化。1、磷酸化:信號轉導、細胞周期、生長發育機理等;2、糖基化:蛋白質折疊、更新以及免疫應答等;3、乙酰化:基因表達調控、細胞凋亡、細胞代謝、蛋白質穩定性以及神經退行性的病變等;4、泛素化:細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA修復以及信號轉導等;5、甲基化:染色質結構及轉錄調控等;6、丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于線粒體和細菌中,與代謝過程密切相關。蛋白質磷酸化修飾怎么定義?廣東氧化修飾蛋白質組學有哪些類型
蛋白質磷酸化修飾鑒定方法: Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳:Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳通過連接在丙烯酰胺分子上的雙核金屬(如Mn2+)配合物對磷酸基團的親和,造成磷酸化蛋白遷移的滯留,再將電泳結果轉移到PVDF膜上,用相應蛋白的抗體識別,根據遷移滯留檢測蛋白磷酸化。技術優勢特點:1、無放射危害。2、鑒定不受限于特異性識別蛋白質磷酸化的抗體。3、適用于大規模磷酸化蛋白分析。4、與質譜鑒定兼容,進行更為精細的分析鑒定。山東泛素化修飾PRM定量驗證蛋白質翻譯后修飾有什么生物學意義?
蛋白質磷酸化修飾類型:根據磷酸氨基酸殘基的不同,可將磷酸化蛋白質分為4類,即O-磷酸鹽蛋白質、N-磷酸鹽蛋白質、酰基磷酸鹽蛋白質和S-磷酸鹽蛋白質。1、O-磷酸鹽蛋白質通過羥氨基酸(如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸)的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質通過精氨酸、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成。3、 酰基磷酸鹽蛋白質通過天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸鹽蛋白質通過半胱氨酸磷酸化形成。蛋白質磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術是在凝膠電泳和固相免疫測定技術基礎上發展起來的、根據特定抗原-抗體的特異性反應來檢測復雜樣品中的某種蛋白質的免疫生化分析方法。
蛋白質乙酰化修飾鑒定流程:1. 組織/細胞破碎,提取、提純目的蛋白質。2. 使用胰蛋白酶將目的蛋白酶解成多肽片段。3. 使用高效特異性乙酰化抗體對乙酰化修飾肽段進行免疫富集。4. 使用LC-MS/MS對富集的乙酰化肽段進行鑒定分析。5. 數據分析,并對鑒定的乙酰化位點的生物學功能進行解釋預測。隨著蛋白質組研究的發展,我們越來越深刻地意識到,對于生物體生命活動的管理和調控過程,密切相關的不只是單個蛋白質層面的修飾狀態,更重要的是研究蛋白質組學水平研究在翻譯后修飾的動態變化。高質、高效的蛋白質翻譯后修飾富集技術和豐富的、準確的定量手段使得研究蛋白質水平的翻譯后修飾組學成為現實,借助這些組學研究手段能夠實現不同生理病理狀態下生物樣本在翻譯后修飾水平上的定量比較,深入地揭示翻譯后修飾水平的波動與生物生命活動的密切聯系。蛋白質的翻譯后修飾調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。
蛋白質翻譯后修飾:蛋白質的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質與底物蛋白質上特定的氨基酸結合,調控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。各種蛋白質翻譯后修飾在信號通路和網絡中發揮著重要的作用,翻譯后修飾系統的紊亂將導致一系列疾病的發生。通過實驗的方法鑒定蛋白質翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間,并且酶反應的優化常常難以實現。而計算的方法則能夠快速、準確的預測酶特異性的底物蛋白質及其修飾位點。蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有靈活的特性。武漢磷酸化修飾蛋白質組學有哪些類型
乙酰化修飾是原核和真核生物所共有的一種翻譯后修飾類型。廣東氧化修飾蛋白質組學有哪些類型
蛋白質翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質組研究的大部分工作集中在細胞生長的不同時期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質表達水平的變化。然而,許多生命過程不只受蛋白質的相對豐度控制,還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此,揭示翻譯后修飾的規律是了解蛋白質復雜性和多樣的生物學功能的前提。蛋白質的翻譯后修飾是一個復雜的過程。目前,發現的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。樣品中翻譯后修飾蛋白質含量低、動態范圍廣給相關研究帶來了很大的挑戰。基于翻譯后修飾蛋白的異質性和相對豐度低的特點,主要利用凝膠、生物質譜和生物信息學工具對其進行研究。用于PTM分析的質譜方法類似于用于“常規”蛋白質鑒定的方法,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白質組學分析。廣東氧化修飾蛋白質組學有哪些類型
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