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貴陽個性化定制靶向代謝組學研究方法

來源: 發布時間:2022-02-17

代謝組學介紹:通過液質聯用(LC-MS)方法檢測生物體受外界刺激前后體內大多數小分子代謝物的動態變化,重點尋找在實驗組和對照組中有明顯變化的代謝物,進而研究這些代謝物與生理病理變化的相關關系,其研究對象大多是分子量1500Da以內的小分子物質。技術優勢:較高的靈敏度、分辨率;較寬的動態范圍;適合對標本中未知代謝物的探索研究;適合于生物樣本中復雜代謝產物的檢測和潛在標志物的鑒定。代謝組學應用方向: 土壤代謝組學。研究土壤中有機質及土壤微生物代謝含量變化及相互作用,了解土壤微生物多樣性及其碳代謝能力,為探索調節、控制和改善土壤環境質量提供重要的參考。代謝組學作為系統生物學的重要組成部分,在臨床醫學領域具有普遍的應用前景。貴陽個性化定制靶向代謝組學研究方法

GC-MS非靶向代謝組學能檢測到哪些類別的代謝物?衍生化極大地拓展了GC/MS的檢測分析范圍。GC/MS能檢測到有機酸、氨基酸、單糖、糖醇、胺類、脂肪酸、吲哚、單甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和膽汁酸等代謝物。如何提高定性準確度?GC/MS的定性有雙重標準,一是保留指數,二是質譜信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的軟電離源,GC/MS使用的EI源屬于硬電離,能量較強且穩定,在將代謝物分子電離后,分子離子峰進一步碎裂產生豐富的碎片離子。因此,我們很難在GC/MS上看到分子離子峰。GC/MS提供的是代謝物的“指紋圖譜”,將儀器得到的實際指紋圖譜和質譜庫(如NIST庫)進行比對后,我們將會得到一個叫相似度的指標。保留指數和相似度都必須滿足設定的閾值,軟件才會給出色譜峰的定性結果。然后采用標準品質譜信息進行完全比對定性,也就是說只有經過標準品比對,代謝物才是被100%定性。浙江LC-MS/MS非靶向代謝組學技術代謝組學主要研究的是各種代謝路徑的底物。

代謝組學的研究對象與層次有哪些?一般來說,代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據研究的對象和目的不同,科學家將生物體系的代謝產物分析分為4個層次:代謝物靶標分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,如某一類結構、性質相關的化合物(氨基酸、有機酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產物或多條代謝途徑的標志性組分。代謝物指紋分析:同時對多個代謝物進行分析,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內特定組織內的代謝產物的快速定性和半定量分析。代謝組分析:對生物體或體內某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,并研究該代謝物組在外界干預或病理生理條件下的動態變化規律。

代謝組學有哪些特點?(1) 代謝處于系統生物學的末端,更能反映基因與外部環境互作的真實情況,因此,在多數生物表型研究上更加適用。(2) 常規代謝組學只關注內源性化合物,也有使用代謝組學技術測定外源性化合物的。內源性化合物的上調和下調指示了與疾病、毒性、基因修飾或環境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 內源性化合物的結果可以作為疾病的診斷、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標志物。謝組學通過揭示內在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發展過程。代謝組學技術可應用于功能基因組學。

代謝組學需要多少的生物學重復?生物學重復指的是相同處理的相同類型的生物樣本的數量(如相同劑量給藥后2小時的小鼠采集并且相同儲存條件和處理方法血清樣本)。相較于基因和蛋白,代謝物處于生命活動的下游,收到環境和遺傳背景等因素影響較大,生物學重復少可能會放大組內差異對于整體差異的影響,進而影響結果(如準確和足夠多的找出生物標志物)。因此根據不同的生物類型,需要不同的生物學重復來增加數據的可靠性和說服力。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似。代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似。湖北植物靶向代謝組學檢測多少錢

代謝組學主要技術手段是核磁共振。貴陽個性化定制靶向代謝組學研究方法

代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質組學相比, 代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規律,目前據此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰,研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產物發生相應的改變,通過對某些代謝產物進行分析,并與 正常人的代謝產物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。貴陽個性化定制靶向代謝組學研究方法

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