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濟南常規(guī)靶向代謝組學研究方法

來源: 發(fā)布時間:2022-02-16

代謝組學概念:代謝組學(metabonomics/metabolomics)是效仿基因組學和蛋白質組學的研究思想,對生物體內所有代謝物進行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關系的研究方式,是系統(tǒng)生物學的組成部分。其研究對象大都是相對分子質量1000以內的小分子物質。先進分析檢測技術結合模式識別和**系統(tǒng)等計算分析方法是代謝組學研究的基本方法。 代謝組學是繼基因組學和蛋白質組學之后新近發(fā)展起來的一門學科,是系統(tǒng)生物學的重要組成部分。基因組學和蛋白質組學分別從基因和蛋白質層面探尋生命的活動,而實際上細胞內許多生命活動是發(fā)生在代謝物層面的,如細胞信號釋放(cell signaling),能量傳遞,細胞間通信等都是受代謝物調控的。代謝組學正是研究代謝組(metabolome)——在某一時刻細胞內所有代謝物的組合——的一門學科。代謝組學可以檢測的樣品種類有哪些?濟南常規(guī)靶向代謝組學研究方法

代謝組學疾病診斷應用:與基因組學和蛋白質組學相比, 代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據此目標相距甚遠。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅信,與基因組學和蛋白質組學相比,代謝組學與生理學的聯(lián)系更加緊密。疾病導致機體病理生理過程變化,引起代謝產物發(fā)生相應的改變,通過對某些代謝產物進行分析,并與 正常人的代謝產物比較,尋找疾病的生物標記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。浙江農學靶向代謝組學技術服務代謝組學技術可應用于病因病機研究。

代謝組學有哪些特點?(1) 代謝處于系統(tǒng)生物學的末端,更能反映基因與外部環(huán)境互作的真實情況,因此,在多數生物表型研究上更加適用。(2) 常規(guī)代謝組學只關注內源性化合物,也有使用代謝組學技術測定外源性化合物的。內源性化合物的上調和下調指示了與疾病、毒性、基因修飾或環(huán)境因子的影響。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 內源性化合物的結果可以作為疾病的診斷、藥物篩選或者其他分型評估等潛在生物標志物。謝組學通過揭示內在和外在因素影響下,生物體的代謝整體的變化軌跡來反映某種生理或病理的一系列發(fā)展過程。

如何獲得高質量GC/MS代謝組學數據?實驗設計先不談,在儀器分析階段,若想獲得高質量數據,有以下幾個方面需要注意。1)前處理方法的一致性。不同實驗人員操作方式不盡相同。因此,一個項目應當只由一個人負責前處理。推薦使用自動衍生設備,以減少人為的誤差。2)檢測之前需確保儀器處于比較好工作狀態(tài)。儀器的控制軟件都有系統(tǒng)自檢功能,可以快速便捷地核查質譜儀器的狀態(tài)。但更重要的是氣相色譜狀態(tài),推薦使用一組混標作為儀器質控。在每一個項目開始之前,先進行質控樣檢測,確認氣相色譜的分離度和質譜的整體響應。3)后期數據矯正,特別是對于大樣本項目。我們可以在檢測序列中加入隨行質控樣本(每個樣品取少量后混合),在后期數據處理時,使用質控樣本結合如LOESS之類的算法對整體數據進行矯正。與基因組學和蛋白質組學相比, 代謝組學的研究側重于相關特定組分的共性。

代謝組學發(fā)展至今,代謝組學技術已經遠遠超出了標準臨床化學技術的范圍,能夠精確分析數百至數千種代謝物。代謝組學提供了代謝表型的詳細表征,并可以在許多水平上進行精密醫(yī)學研究,包括表征疾病基礎的代謝紊亂,發(fā)現新的治靶標以及發(fā)現可用于診斷疾病或監(jiān)測藥物的活性。比較常見的代謝組學分析方法是質譜(MS)核磁共振(NMR)光譜。質譜技術又分為LC-MS和GC-MS。其基本原理是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質比的帶電荷的離子,經加速電場的作用,形成離子束,進入質量分析器。代謝組學研究對象大都是相對分子質量1000以內的小分子物質。濟南脂質代謝組學多研究方法

代謝組學關注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。濟南常規(guī)靶向代謝組學研究方法

代謝組學概念:代謝組學主要研究的是作為各種代謝路徑的底物和產物的小分子代謝物(MW<1000)。 在食品安全領域,利用代謝組學工具發(fā)現農獸藥等在動植物體內的相關生物標志物也是一個熱點領域。其樣品主要是動植物的細胞和組織的提取液。主要技術手段是核磁共振(NMR),質譜(MS),色譜(HPLC,GC),其中以NMR為主。通過檢測一系列樣品的NMR 譜圖,再結合模式識別方法,可以判斷出生物體的病理生理狀態(tài),并有可能找出與之相關的生物標志物(biomarker)。濟南常規(guī)靶向代謝組學研究方法

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