常規(guī)蛋白質組學：Labelfree多肽組學：顧名思義，就是不使用任何標記方法，直接對肽段進行質譜鑒定和定性定量分析。實驗流程簡單，只需要對蛋白進行常規(guī)酶解和除鹽步驟即可上機。定量方式分為兩種：峰面積（Peakintensity）和峰計數（Spectralcount），常用的是峰面積。不過，由于質譜采集時只選取topN的母離子進行二級碎裂和MS2檢測，所以會丟失一些豐度較低的肽段信息，缺失值比較多。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學：TMT全稱是TandemMassTag，是經典化學標記試劑，普遍用于差異表達蛋白質組分析研究中。該技術采用6重、10重或16重同位素標簽，與肽段的氨基發(fā)生共價結合反應，可實現同時對6個/10個/16個不同樣品中蛋白質的定性和定量分析。（目前16標鹿明生物可提供技術服務）。蛋白質組與基因組相對應，也是一個整體的概念。浙江定量蛋白組學技術服務

蛋白質組學研究這樣做：蛋白質組與基因組相對應，也是一個整體的概念，隨著基因組學研究的不斷深入，蛋白質組學已逐漸成為研究熱點，對蛋白組學的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質，但探究成千上萬的蛋白質特性也是一個重大的技術挑戰(zhàn)。蛋白質組（Proteome）指的是某一時刻或某一狀態(tài)基因組表達的所有相應的蛋白，即細胞、組織或機體全部蛋白質的存在及活動形式，其是一個動態(tài)概念，它是在組織、細胞的整體蛋白質水平上，探索蛋白質作用模式、功能機理、調節(jié)控制以及蛋白質群體內的相互關系、從而獲得生命活動調控網絡的全方面而深入的認識，以揭示生命活動的基本規(guī)律。深圳蛋白質定量組學分析方法蛋白質組學相關技術目前在一小部分]應用中具有獨特優(yōu)勢。

蛋白質組學主要以全蛋白組（組織、細胞）、線粒體蛋白組、葉綠體蛋白組和外泌體蛋白組為研究對象，通過對蛋白組進行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物學功能、作用機制、疾病診斷的標志物以及預測蛋白的上、下游變化關系。蛋白質組學可以克服核酸水平預測的不確定性、反映核酸翻譯后修飾情況。常用技術：非靶向蛋白組學：蛋白質定性（膠條鑒定和溶液鑒定），高通量定量蛋白組（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽組學。

定量蛋白質組學技術：定量蛋白質組學技術主要分為標記（label）和非標記（labelfree）定量策略，標記策略又分為體內標記和體外標記兩種。細胞內蛋白質組豐度的動態(tài)變化對各種生命過程有重要影響。例如在許多疾病的發(fā)生和發(fā)展進程中，常常伴隨著某些蛋白質的表達異常。定量蛋白質組學就是把一個基因組表達的全部蛋白質或一個復雜的混合體系中所有的蛋白質進行精確的定量和鑒定。非標記（labelfree）的定量蛋白組學技術，Labelfree定量蛋白組學技術是通過液質聯用技術對蛋白質酶解肽段進行質譜分析，無需使用昂貴的穩(wěn)定同位素標簽做內部標準，只需分析大規(guī)模鑒定蛋白質時所產生的質譜數據，比較不同樣品中相應肽段的信號強度，從而對肽段對應的蛋白質進行相對定量。蛋白質組研究技術在研究對象上，覆蓋了原核微生物、真核微生物、植物和動物等范圍。

蛋白質組學在生物學領域的研究中的應用是怎樣的？研究對象涉及到生物體且生物體內表達蛋白，理論上都可以應用蛋白質組學。蛋白質組學是以研究生物體蛋白組成及其變化規(guī)律為目的的應用科學。主要使用的儀器為液質聯用高分辨率質譜儀。詳細來說，蛋白質組學包含許多分支：非標定量蛋白質組學（定性研究生物體的蛋白組成），定量蛋白質組學（對生物體蛋白表達含量進行測定），修飾蛋白質組學（對蛋白質翻譯后修飾進行檢測）及相互作用蛋白質組研究（蛋白質直接相互作用機制解析）等。蛋白質組學屬于后基因組時代的科學研究，針對基因表達產物進行檢測與定量。因此更能反應出生物體生理條件下的水平與狀態(tài)。蛋白質組學將成為尋找疾病分子標記和藥物靶標比較有效的方法之一。山東Label free非標記定量蛋白質組學一般流程

蛋白質組學技術的發(fā)展已經成為現代的生物技術快速發(fā)展的重要支撐。浙江定量蛋白組學技術服務

蛋白質組學在醫(yī)學的研究應用：蛋白質組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規(guī)律的科學，包括對蛋白質表達模式和蛋白質組功能模式的研究。蛋白質組學的發(fā)展對尋找疾病的診斷標志、篩選藥物靶點、毒理學研究等有重要意義，也因此被普遍應用于醫(yī)學研究。蛋白質組學研究，總體可分為一下幾個步驟：（1）差異篩選（Discovery）（2）初步驗證（Verification）（3）然后確診（Validation）。基于質譜的蛋白質組學是目前比較主流的高通量蛋白質研究手段，當前在醫(yī)療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉化醫(yī)學。浙江定量蛋白組學技術服務

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