蛋白質組學在醫學的研究應用：蛋白質組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規律的科學，包括對蛋白質表達模式和蛋白質組功能模式的研究。蛋白質組學的發展對尋找疾病的診斷標志、篩選藥物靶點、毒理學研究等有重要意義，也因此被普遍應用于醫學研究。蛋白質組學研究，總體可分為一下幾個步驟：（1）差異篩選（Discovery）（2）初步驗證（Verification）（3）然后確診（Validation）。基于質譜的蛋白質組學是目前比較主流的高通量蛋白質研究手段，當前在醫療健康方面的應用主要集中于基礎研究和轉化醫學。蛋白質組學是以蛋白質組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規律的科學。武漢修飾蛋白組學

Labelfree非標記定量蛋白質組學技術特點：（1）不需要標記處理，操作簡單，成本低、實驗周期短；（2）每個樣品單獨處理、上機；（3）可以做任意樣本的總蛋白質差異定量，樣品類型不受限制；（4）對單個樣品的蛋白總量要求相對較低，對于組織本身蛋白量不高，可以選擇Label-Free，適用于一些難收集樣品；（5）定性沒有問題，但是定量的準確性較標記定量稍差，會受到質譜穩定性等因素的影響；（6）適合于大樣本量的定量比較（大于24個樣本）。蛋白質組學在醫學的研究應用：蛋白質組學(Proteomics)是研究細胞、組織或生物體中蛋白質組成、定位、變化及其相互作用規律的科學。河南外泌體蛋白質組學方法蛋白質組學的研究主要促進分子醫學的發展。

我國科學家已經在重大疾病如肝病、維甲酸誘導白血病細胞凋亡啟動模型及維甲酸定向誘導胚胎干細胞向神經系統分化的模型等比較蛋白質組研究以及一些重要生理和病理體系的蛋白質組成分研究方面獲得了重要成就。蛋白質組學的重要應用領域有：在臨床疾病中的應用、在微生物蛋白質組學中的應用、在植物研究中的應用、在腎臟病學領域的應用。我們通過研究蛋白質組，可以為患者提供有用的疾病診斷、診療、預后評估信息；可以早期更為準確的診斷出胰腺病；也可以為AD的診斷、診療藥物的設計和篩選奠定基礎。這項研究技術其實離我們生活非常近，對我們生命而言尤為重要。近年來，高通量蛋白質分離與鑒定技術，如雙向電泳、生物質譜、蛋白質芯片、酵母雙雜交系統、生物信息學等相繼建立并日趨完善，加速了蛋白質組學的發展。

蛋白質組的研究不但能為生命活動規律提供物質基礎，也能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。通過對正常個體及病理個體間的蛋白質組比較分析，我們可以找到某些“疾病特異性的蛋白質分子”，它們可成為新藥物設計的分子靶點，或者也會為疾病的早期診斷提供分子標志。確實，那些世界范圍內銷路比較好的藥物本身是蛋白質或其作用靶點為某種蛋白質分子。因此，蛋白質組學研究不只是探索生命奧秘的必須工作，也能為人類健康事業帶來巨大的利益。蛋白質組學的研究是生命科學進入后基因時代的特征。蛋白質組學技術并帶領生物技術取得關鍵性的突破。

非標定量法(Label-free)是通過比較質譜分析次數或質譜峰強度，分析不同來源樣品蛋白的數量變化，認為肽段在質譜中被捕獲檢測的頻率與其在混合物中的豐度成正相關，因此蛋白質被質譜檢測的計數反映了蛋白質的豐度，通過適當的數學公式可以將質譜檢測計數與蛋白質的量聯系起來,從而對蛋白質進行定量。按照其原理主要分為兩種，第1種spectrumcounts類的非標記方法，發展比較早，已經形成多種定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鑒定結果為定量基礎，各種方法的差別在于后期算法在大規模數據上的修正。第二種非標記定量的原理是以MS1為基礎，計算每個肽段的信號強度在LC-MS上的積分。蛋白質組的研究能為眾多種疾病機理的闡明及攻克提供理論根據和解決途徑。河南外泌體蛋白質組學方法

生物質譜技術是蛋白質組學研究中比較重要的鑒定技術。武漢修飾蛋白組學

常規蛋白質組學：Labelfree多肽組學：顧名思義，就是不使用任何標記方法，直接對肽段進行質譜鑒定和定性定量分析。實驗流程簡單，只需要對蛋白進行常規酶解和除鹽步驟即可上機。定量方式分為兩種：峰面積（Peakintensity）和峰計數（Spectralcount），常用的是峰面積。不過，由于質譜采集時只選取topN的母離子進行二級碎裂和MS2檢測，所以會丟失一些豐度較低的肽段信息，缺失值比較多。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學：TMT全稱是TandemMassTag，是經典化學標記試劑，普遍用于差異表達蛋白質組分析研究中。該技術采用6重、10重或16重同位素標簽，與肽段的氨基發生共價結合反應，可實現同時對6個/10個/16個不同樣品中蛋白質的定性和定量分析。（目前16標鹿明生物可提供技術服務）。武漢修飾蛋白組學

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