橋式擴增是指將DNA模板固定在表面上，并用適當引物引導其進行二倍體擴增，形成橋形結構，后續進行測序。具體步驟如下：DNA片段連接和固定：首先，將待測序的DNA樣品通過化學處理連接到測序平臺上的固定引物上。固定引物通常是親水性的，能夠有效固定DNA分子在平臺表面上。橋式擴增：每一個DNA片段都會在平臺表面上擴增成橋形結構。這一過程是通過引物的作用，在固定的DNA片段上進行逐一擴增，形成橋形結構。芯片掃描：經過橋式擴增后的DNA橋結構會通過芯片掃描成像，以獲取其位置和序列信息。橋式擴增技術的在于將DNA固定在平臺上，并通過引物的導向實現二倍體擴增，終形成橋形結構進行測序。這一步驟的高效實現了Illumina測序技術的高通量特性。真核無參轉錄組測序揭示發育調控網絡的結構和功能。全轉錄組測序外包
長讀長的特性賦予了它獨特的優勢。首先，它能夠更清晰地解析基因的完整結構，包括外顯子、內含子以及它們之間的邊界。這對于準確理解基因的功能和調控機制至關重要。例如，在研究可變剪接時，長讀長測序可以更好地捕捉到不同剪接變體的全貌，而不是像短讀長測序那樣可能會遺漏一些關鍵信息。其次，長讀長RNA-seq對于研究長鏈非編碼RNA等具有復雜結構的RNA分子也具有重要意義。這些非編碼RNA通常具有較長的長度和復雜的結構，短讀長測序可能難以準確地描繪它們的特征。而長讀長測序則能夠更好地揭示它們的真實面貌，為深入研究它們的生物學功能提供有力支持。全轉錄組測序外包鏈特異性轉錄組學為基因調控和生物功能研究提供更多可能性。
長讀長 RNA-seq 在研究基因融合等基因組異常方面也表現出了的性能�；蛉诤鲜窃S多疾病，發生的重要機制之一。通過長讀長測序，我們可以更準確地檢測到這些融合事件，為疾病的診斷和提供更精確的依據。當然，長讀長RNA-seq也并非完美無缺。它在技術上仍然面臨著一些挑戰，例如測序成本較高、數據準確性有待進一步提高等。但不可否認的是，它的出現為基因研究帶來了新的突破和機遇。在實際應用中，Illumina 短讀長測序平臺和長讀長 RNA-seq 可以相互補充，共同推動基因研究的發展。短讀長測序可以繼續發揮其在大規模基因表達分析、差異表達基因篩選等方面的優勢，而長讀長 RNA-seq 則可以專注于解決那些需要更精細基因結構解析的問題。
Illumina 測序技術是一種廣泛應用于基因組學研究、疾病診斷和藥物開發領域的高通量測序技術。它基于橋式擴增（bridge amplification）和同步測序（sequencing by synthesis）原理，能夠快速產生大量高質量的序列數據。下面將詳細介紹 Illumina 測序技術的原理、測序流程及技術優勢。Illumina 測序技術的原理是橋式擴增和同步測序。首先，將 DNA 樣本切成小片段，然后將每個片段的兩端與特定的接頭連接，形成 DNA 文庫。接下來，將 DNA 文庫加載到 Illumina 測序芯片上，每個 DN段會在芯片上形成一個橋式結構。真核無參轉錄組可以揭示疾病相關的基因表達變化，為診斷提供新的思路。
隨著科學研究的不斷深入，人們對基因結構和功能的理解也在不斷深化。在這個過程中，短讀長測序平臺逐漸暴露出一些局限性。雖然它能夠提供海量的數據，但在面對一些復雜的基因結構問題時，往往顯得力不從心。例如，對于一些具有高度可變剪接、長鏈非編碼RNA以及復雜的基因融合等情況，短讀長測序的數據可能難以準確解析。正是在這種背景下，長讀長（long-read）RNA-seq的出現猶如一道曙光，為解決這些難題帶來了新的希望。長讀長RNA-seq的進步使得我們能夠更準確地研究基因結構。與短讀長測序不同，長讀長測序能夠產生更長的序列片段，從而能夠跨越整個基因甚至更大的基因組區域。鏈特異性轉錄組能夠更準確地統計轉錄本的數量。全轉錄組測序外包
真核無參轉錄組使得我們理解基因調控網絡如何響應環境變化和內部信號進行調整。全轉錄組測序外包
在基因測序的廣闊領域中，Illumina的短讀長（short-read）測序平臺無疑占據著重要的一席之地。它以其高效、準確和廣泛應用的特點，成為了眾多研究人員的得力工具。這個強大的平臺能夠對由大部分不同方法構建的RNA-seq文庫進行測序，為我們開啟了一扇深入了解基因表達和調控的大門。Illumina短讀長測序平臺的優勢在于其能夠產生大量的短序列數據，這些數據可以提供關于基因表達水平、轉錄本變異等豐富的信息。通過對這些短序列的分析，研究人員可以構建基因表達圖譜、鑒定差異表達基因，以及探索各種生物學過程中的基因調控網絡。全轉錄組測序外包
